Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Prkab1Q9R078 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Prkab1Q9R078 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Prkab1Q9R078 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prkab1Q9R078 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prkab1Q9R078 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prkab1Q9R078 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prkab1Q9R078 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prkab1Q9R078 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prkab1Q9R078 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prkab1Q9R078 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prkab1Q9R078 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prkab1Q9R078 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkab1Q9R078 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Prkab1Q9R078 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prkab1Q9R078 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prkab1Q9R078 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Prkab1Q9R078 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Prkab1Q9R078 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prkab1Q9R078 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prkab1Q9R078 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.3 ms