Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh2d3cQ9QZS8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh2d3cQ9QZS8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh2d3cQ9QZS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d3cQ9QZS8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh2d3cQ9QZS8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh2d3cQ9QZS8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh2d3cQ9QZS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh2d3cQ9QZS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sh2d3cQ9QZS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms