Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col4a3Q9QZS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col4a3Q9QZS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Col4a3Q9QZS0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Col4a3Q9QZS0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col4a3Q9QZS0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col4a3Q9QZS0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Col4a3Q9QZS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Col4a3Q9QZS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col4a3Q9QZS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col4a3Q9QZS0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Col4a3Q9QZS0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col4a3Q9QZS0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a3Q9QZS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a3Q9QZS0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a3Q9QZS0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a3Q9QZS0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a3Q9QZS0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a3Q9QZS0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms