Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2afyQ9QZQ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
H2afyQ9QZQ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2afyQ9QZQ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2afyQ9QZQ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2afyQ9QZQ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2afyQ9QZQ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afyQ9QZQ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H2afyQ9QZQ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2afyQ9QZQ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2afyQ9QZQ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2afyQ9QZQ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2afyQ9QZQ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.9 ms