Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ercc4Q9QZD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc4Q9QZD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc4Q9QZD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc4Q9QZD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc4Q9QZD4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ercc4Q9QZD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ercc4Q9QZD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc4Q9QZD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc4Q9QZD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms