Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps29Q9QZ88 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps29Q9QZ88 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps29Q9QZ88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps29Q9QZ88 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps29Q9QZ88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps29Q9QZ88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps29Q9QZ88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps29Q9QZ88 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps29Q9QZ88 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps29Q9QZ88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps29Q9QZ88 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps29Q9QZ88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps29Q9QZ88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps29Q9QZ88 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps29Q9QZ88 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps29Q9QZ88 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps29Q9QZ88 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms