Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc39a1Q9QZ03 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc39a1Q9QZ03 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc39a1Q9QZ03 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc39a1Q9QZ03 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc39a1Q9QZ03 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc39a1Q9QZ03 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc39a1Q9QZ03 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc39a1Q9QZ03 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc39a1Q9QZ03 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms