Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copg2Q9QXK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Copg2Q9QXK3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Copg2Q9QXK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Copg2Q9QXK3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Copg2Q9QXK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Copg2Q9QXK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Copg2Q9QXK3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copg2Q9QXK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Copg2Q9QXK3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copg2Q9QXK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copg2Q9QXK3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copg2Q9QXK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copg2Q9QXK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Copg2Q9QXK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms