Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms