Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arl6ip4Q9JM93 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arl6ip4Q9JM93 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arl6ip4Q9JM93 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arl6ip4Q9JM93 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arl6ip4Q9JM93 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Arl6ip4Q9JM93 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arl6ip4Q9JM93 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Arl6ip4Q9JM93 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Arl6ip4Q9JM93 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arl6ip4Q9JM93 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Arl6ip4Q9JM93 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Arl6ip4Q9JM93 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arl6ip4Q9JM93 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Arl6ip4Q9JM93 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arl6ip4Q9JM93 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arl6ip4Q9JM93 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arl6ip4Q9JM93 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arl6ip4Q9JM93 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arl6ip4Q9JM93 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Arl6ip4Q9JM93 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arl6ip4Q9JM93 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arl6ip4Q9JM93 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arl6ip4Q9JM93 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arl6ip4Q9JM93 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Arl6ip4Q9JM93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms