Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hmgn5Q9JL35 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hmgn5Q9JL35 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hmgn5Q9JL35 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hmgn5Q9JL35 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hmgn5Q9JL35 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hmgn5Q9JL35 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hmgn5Q9JL35 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Hmgn5Q9JL35 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hmgn5Q9JL35 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hmgn5Q9JL35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms