Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pole3Q9JKP7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole3Q9JKP7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole3Q9JKP7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pole3Q9JKP7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pole3Q9JKP7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pole3Q9JKP7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pole3Q9JKP7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pole3Q9JKP7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pole3Q9JKP7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms