Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trem1Q9JKE2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trem1Q9JKE2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem1Q9JKE2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trem1Q9JKE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trem1Q9JKE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trem1Q9JKE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trem1Q9JKE2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trem1Q9JKE2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms