Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smpd3Q9JJY3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smpd3Q9JJY3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smpd3Q9JJY3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smpd3Q9JJY3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smpd3Q9JJY3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smpd3Q9JJY3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd3Q9JJY3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd3Q9JJY3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smpd3Q9JJY3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smpd3Q9JJY3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smpd3Q9JJY3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd3Q9JJY3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd3Q9JJY3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms