Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Akip1Q9JJR5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Akip1Q9JJR5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Akip1Q9JJR5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Akip1Q9JJR5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Akip1Q9JJR5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Akip1Q9JJR5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Akip1Q9JJR5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Akip1Q9JJR5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Akip1Q9JJR5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Akip1Q9JJR5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Akip1Q9JJR5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Akip1Q9JJR5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Akip1Q9JJR5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Akip1Q9JJR5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Akip1Q9JJR5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Akip1Q9JJR5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Akip1Q9JJR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Akip1Q9JJR5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Akip1Q9JJR5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Akip1Q9JJR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Akip1Q9JJR5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Akip1Q9JJR5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Akip1Q9JJR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Akip1Q9JJR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Akip1Q9JJR5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Akip1Q9JJR5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Akip1Q9JJR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Akip1Q9JJR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Akip1Q9JJR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Akip1Q9JJR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Akip1Q9JJR5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Akip1Q9JJR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms