Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc86Q9JJ89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc86Q9JJ89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc86Q9JJ89 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc86Q9JJ89 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc86Q9JJ89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc86Q9JJ89 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc86Q9JJ89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc86Q9JJ89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc86Q9JJ89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc86Q9JJ89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc86Q9JJ89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc86Q9JJ89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc86Q9JJ89 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms