Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ercc6l2Q9JIM3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ercc6l2Q9JIM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ercc6l2Q9JIM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ercc6l2Q9JIM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ercc6l2Q9JIM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ercc6l2Q9JIM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ercc6l2Q9JIM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Ercc6l2Q9JIM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Ercc6l2Q9JIM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Ercc6l2Q9JIM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ercc6l2Q9JIM3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ercc6l2Q9JIM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Ercc6l2Q9JIM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Ercc6l2Q9JIM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Ercc6l2Q9JIM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ercc6l2Q9JIM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ercc6l2Q9JIM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ercc6l2Q9JIM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ercc6l2Q9JIM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ercc6l2Q9JIM3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ercc6l2Q9JIM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ercc6l2Q9JIM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ercc6l2Q9JIM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Ercc6l2Q9JIM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ercc6l2Q9JIM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ercc6l2Q9JIM3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ercc6l2Q9JIM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ercc6l2Q9JIM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ercc6l2Q9JIM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ercc6l2Q9JIM3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ercc6l2Q9JIM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ercc6l2Q9JIM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ercc6l2Q9JIM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Ercc6l2Q9JIM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ercc6l2Q9JIM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ercc6l2Q9JIM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ercc6l2Q9JIM3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ercc6l2Q9JIM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ercc6l2Q9JIM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ercc6l2Q9JIM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ercc6l2Q9JIM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ercc6l2Q9JIM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ercc6l2Q9JIM3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ercc6l2Q9JIM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ercc6l2Q9JIM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ercc6l2Q9JIM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Ercc6l2Q9JIM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ercc6l2Q9JIM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ercc6l2Q9JIM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ercc6l2Q9JIM3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ercc6l2Q9JIM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ercc6l2Q9JIM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ercc6l2Q9JIM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ercc6l2Q9JIM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ercc6l2Q9JIM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ercc6l2Q9JIM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms