Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Pus3Q9JI38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pus3Q9JI38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pus3Q9JI38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Pus3Q9JI38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pus3Q9JI38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pus3Q9JI38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Pus3Q9JI38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Pus3Q9JI38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pus3Q9JI38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Pus3Q9JI38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pus3Q9JI38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pus3Q9JI38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pus3Q9JI38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pus3Q9JI38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pus3Q9JI38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms