Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI33

Ntn4, Netrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn4Q9JI33 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ntn4Q9JI33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ntn4Q9JI33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ntn4Q9JI33 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ntn4Q9JI33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ntn4Q9JI33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ntn4Q9JI33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ntn4Q9JI33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms