Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET39

Slamf6, SLAM family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf6Q9ET39 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slamf6Q9ET39 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slamf6Q9ET39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slamf6Q9ET39 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slamf6Q9ET39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slamf6Q9ET39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slamf6Q9ET39 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slamf6Q9ET39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slamf6Q9ET39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms