Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc5a4aQ9ET37 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc5a4aQ9ET37 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc5a4aQ9ET37 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc5a4aQ9ET37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc5a4aQ9ET37 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4aQ9ET37 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4aQ9ET37 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4aQ9ET37 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc5a4aQ9ET37 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Slc5a4aQ9ET37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Slc5a4aQ9ET37 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Slc5a4aQ9ET37 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc5a4aQ9ET37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc5a4aQ9ET37 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc5a4aQ9ET37 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc5a4aQ9ET37 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc5a4aQ9ET37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc5a4aQ9ET37 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc5a4aQ9ET37 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc5a4aQ9ET37 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms