Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES89

Extl2, Exostosin-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl2Q9ES89 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Extl2Q9ES89 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Extl2Q9ES89 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Extl2Q9ES89 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Extl2Q9ES89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Extl2Q9ES89 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Extl2Q9ES89 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Extl2Q9ES89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Extl2Q9ES89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Extl2Q9ES89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Extl2Q9ES89 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Extl2Q9ES89 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Extl2Q9ES89 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Extl2Q9ES89 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Extl2Q9ES89 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Extl2Q9ES89 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Extl2Q9ES89 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Extl2Q9ES89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Extl2Q9ES89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Extl2Q9ES89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms