Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek6Q9ES70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek6Q9ES70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek6Q9ES70 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek6Q9ES70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek6Q9ES70 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek6Q9ES70 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek6Q9ES70 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nek6Q9ES70 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms