Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cse1lQ9ERK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cse1lQ9ERK4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cse1lQ9ERK4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cse1lQ9ERK4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cse1lQ9ERK4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cse1lQ9ERK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cse1lQ9ERK4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cse1lQ9ERK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cse1lQ9ERK4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cse1lQ9ERK4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cse1lQ9ERK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cse1lQ9ERK4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cse1lQ9ERK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms