Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb3Q9ERD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubb3Q9ERD7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb3Q9ERD7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb3Q9ERD7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb3Q9ERD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb3Q9ERD7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb3Q9ERD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb3Q9ERD7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb3Q9ERD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb3Q9ERD7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms