Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slco1c1Q9ERB5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slco1c1Q9ERB5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slco1c1Q9ERB5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slco1c1Q9ERB5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slco1c1Q9ERB5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slco1c1Q9ERB5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slco1c1Q9ERB5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slco1c1Q9ERB5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slco1c1Q9ERB5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slco1c1Q9ERB5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slco1c1Q9ERB5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slco1c1Q9ERB5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slco1c1Q9ERB5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slco1c1Q9ERB5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slco1c1Q9ERB5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slco1c1Q9ERB5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slco1c1Q9ERB5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slco1c1Q9ERB5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slco1c1Q9ERB5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms