Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tor1bQ9ER41 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tor1bQ9ER41 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tor1bQ9ER41 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tor1bQ9ER41 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tor1bQ9ER41 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor1bQ9ER41 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tor1bQ9ER41 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tor1bQ9ER41 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor1bQ9ER41 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor1bQ9ER41 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tor1bQ9ER41 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tor1bQ9ER41 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tor1bQ9ER41 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tor1bQ9ER41 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tor1bQ9ER41 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tor1bQ9ER41 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms