Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndst3Q9EQH7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndst3Q9EQH7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ndst3Q9EQH7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ndst3Q9EQH7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ndst3Q9EQH7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndst3Q9EQH7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndst3Q9EQH7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndst3Q9EQH7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndst3Q9EQH7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndst3Q9EQH7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndst3Q9EQH7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndst3Q9EQH7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndst3Q9EQH7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndst3Q9EQH7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndst3Q9EQH7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndst3Q9EQH7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ndst3Q9EQH7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndst3Q9EQH7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms