Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r44Q9EQ47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r44Q9EQ47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r44Q9EQ47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r44Q9EQ47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r44Q9EQ47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r44Q9EQ47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r44Q9EQ47 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r44Q9EQ47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r44Q9EQ47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms