Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ropn1lQ9EQ00 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ropn1lQ9EQ00 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ropn1lQ9EQ00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ropn1lQ9EQ00 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ropn1lQ9EQ00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ropn1lQ9EQ00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ropn1lQ9EQ00 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ropn1lQ9EQ00 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ropn1lQ9EQ00 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ropn1lQ9EQ00 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ropn1lQ9EQ00 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ropn1lQ9EQ00 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ropn1lQ9EQ00 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ropn1lQ9EQ00 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ropn1lQ9EQ00 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ropn1lQ9EQ00 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ropn1lQ9EQ00 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1lQ9EQ00 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms