Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tlr1Q9EPQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr1Q9EPQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr1Q9EPQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr1Q9EPQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr1Q9EPQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr1Q9EPQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr1Q9EPQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr1Q9EPQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr1Q9EPQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr1Q9EPQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tlr1Q9EPQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr1Q9EPQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr1Q9EPQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms