Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnmdQ9EP64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnmdQ9EP64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnmdQ9EP64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TnmdQ9EP64 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TnmdQ9EP64 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnmdQ9EP64 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnmdQ9EP64 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TnmdQ9EP64 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TnmdQ9EP64 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TnmdQ9EP64 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TnmdQ9EP64 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TnmdQ9EP64 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TnmdQ9EP64 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TnmdQ9EP64 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TnmdQ9EP64 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TnmdQ9EP64 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms