Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
TnmdQ9EP64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
TnmdQ9EP64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
TnmdQ9EP64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
TnmdQ9EP64 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
TnmdQ9EP64 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
TnmdQ9EP64 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
TnmdQ9EP64 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
TnmdQ9EP64 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
TnmdQ9EP64 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
TnmdQ9EP64 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,69■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
TnmdQ9EP64 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
TnmdQ9EP64 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,53■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28,52■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
TnmdQ9EP64 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,49■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
TnmdQ9EP64 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
TnmdQ9EP64 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,35■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
TnmdQ9EP64 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms