Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc107Q9DCC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc107Q9DCC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc107Q9DCC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc107Q9DCC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc107Q9DCC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc107Q9DCC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc107Q9DCC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc107Q9DCC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms