Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Csnk1dQ9DC28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csnk1dQ9DC28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csnk1dQ9DC28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Csnk1dQ9DC28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Csnk1dQ9DC28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Csnk1dQ9DC28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Csnk1dQ9DC28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Csnk1dQ9DC28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Csnk1dQ9DC28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Csnk1dQ9DC28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Csnk1dQ9DC28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csnk1dQ9DC28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Csnk1dQ9DC28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csnk1dQ9DC28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csnk1dQ9DC28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csnk1dQ9DC28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csnk1dQ9DC28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Csnk1dQ9DC28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csnk1dQ9DC28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Csnk1dQ9DC28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Csnk1dQ9DC28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Csnk1dQ9DC28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csnk1dQ9DC28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Csnk1dQ9DC28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csnk1dQ9DC28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Csnk1dQ9DC28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Csnk1dQ9DC28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csnk1dQ9DC28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Csnk1dQ9DC28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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