Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tm9sf1Q9DBU0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm9sf1Q9DBU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tm9sf1Q9DBU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tm9sf1Q9DBU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm9sf1Q9DBU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm9sf1Q9DBU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms