Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pop5Q9DB28 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pop5Q9DB28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pop5Q9DB28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pop5Q9DB28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pop5Q9DB28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pop5Q9DB28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pop5Q9DB28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pop5Q9DB28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pop5Q9DB28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pop5Q9DB28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pop5Q9DB28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pop5Q9DB28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms