Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Snx5Q9D8U8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,31
Snx5Q9D8U8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Snx5Q9D8U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Snx5Q9D8U8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Snx5Q9D8U8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Snx5Q9D8U8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Snx5Q9D8U8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Snx5Q9D8U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms