Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tvp23bQ9D8T4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tvp23bQ9D8T4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tvp23bQ9D8T4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tvp23bQ9D8T4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tvp23bQ9D8T4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tvp23bQ9D8T4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tvp23bQ9D8T4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms