Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Echdc3Q9D7J9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Echdc3Q9D7J9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Echdc3Q9D7J9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Echdc3Q9D7J9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Echdc3Q9D7J9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Echdc3Q9D7J9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Echdc3Q9D7J9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Echdc3Q9D7J9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc3Q9D7J9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Echdc3Q9D7J9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Echdc3Q9D7J9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Echdc3Q9D7J9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Echdc3Q9D7J9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Echdc3Q9D7J9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Echdc3Q9D7J9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Echdc3Q9D7J9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Echdc3Q9D7J9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Echdc3Q9D7J9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Echdc3Q9D7J9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms