Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhl40Q9D783 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Klhl40Q9D783 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Klhl40Q9D783 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Klhl40Q9D783 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klhl40Q9D783 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Klhl40Q9D783 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Klhl40Q9D783 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Klhl40Q9D783 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Klhl40Q9D783 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms