Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D727 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D727 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D727 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D727 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D727 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D727 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D727 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D727 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D727 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D727 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D727 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D727 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D727 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D727 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D727 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D727 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D727 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D727 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D727 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D727 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D727 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D727 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D727 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D727 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D727 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D727 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D727 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D727 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D727 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D727 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D727 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D727 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D727 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D727 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D727 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D727 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D727 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D727 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D727 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D727 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D727 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D727 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D727 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D727 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D727 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D727 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D727 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D727 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D727 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D727 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D727 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D727 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D727 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D727 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D727 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D727 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D727 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D727 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D727 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D727 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D727 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D727 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D727 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D727 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D727 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D727 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D727 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D727 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D727 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D727 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D727 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D727 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D727 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D727 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D727 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D727 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D727 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D727 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D727 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D727 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D727 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D727 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D727 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D727 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D727 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D727 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D727 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D727 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D727 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D727 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D727 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D727 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D727 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D727 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D727 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D727 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D727 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9D727 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9D727 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms