Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hrct1Q9D6B9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hrct1Q9D6B9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hrct1Q9D6B9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hrct1Q9D6B9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hrct1Q9D6B9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms