Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc81Q9D5W4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc81Q9D5W4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc81Q9D5W4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc81Q9D5W4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc81Q9D5W4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc81Q9D5W4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc81Q9D5W4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc81Q9D5W4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc81Q9D5W4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc81Q9D5W4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc81Q9D5W4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc81Q9D5W4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc81Q9D5W4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc81Q9D5W4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc81Q9D5W4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc81Q9D5W4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc81Q9D5W4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc81Q9D5W4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc81Q9D5W4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms