Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc105Q9D4K7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc105Q9D4K7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc105Q9D4K7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc105Q9D4K7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc105Q9D4K7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc105Q9D4K7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc105Q9D4K7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc105Q9D4K7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc105Q9D4K7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc105Q9D4K7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc105Q9D4K7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc105Q9D4K7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc105Q9D4K7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms