Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubgcp4Q9D4F8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp4Q9D4F8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp4Q9D4F8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp4Q9D4F8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp4Q9D4F8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp4Q9D4F8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tubgcp4Q9D4F8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubgcp4Q9D4F8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp4Q9D4F8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp4Q9D4F8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp4Q9D4F8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp4Q9D4F8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp4Q9D4F8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp4Q9D4F8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp4Q9D4F8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms