Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sohlh2Q9D489 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sohlh2Q9D489 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sohlh2Q9D489 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sohlh2Q9D489 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sohlh2Q9D489 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sohlh2Q9D489 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sohlh2Q9D489 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sohlh2Q9D489 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sohlh2Q9D489 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sohlh2Q9D489 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sohlh2Q9D489 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sohlh2Q9D489 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sohlh2Q9D489 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sohlh2Q9D489 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sohlh2Q9D489 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sohlh2Q9D489 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sohlh2Q9D489 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sohlh2Q9D489 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms