Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3D9

Atp5d, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5dQ9D3D9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5dQ9D3D9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp5dQ9D3D9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp5dQ9D3D9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5dQ9D3D9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp5dQ9D3D9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5dQ9D3D9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp5dQ9D3D9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5dQ9D3D9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp5dQ9D3D9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms