Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SarnpQ9D1J3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SarnpQ9D1J3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SarnpQ9D1J3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SarnpQ9D1J3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SarnpQ9D1J3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SarnpQ9D1J3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SarnpQ9D1J3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SarnpQ9D1J3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SarnpQ9D1J3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SarnpQ9D1J3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms