Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tspan11Q9D1D1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tspan11Q9D1D1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Tspan11Q9D1D1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,56■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
Tspan11Q9D1D1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tspan11Q9D1D1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tspan11Q9D1D1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Tspan11Q9D1D1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Tspan11Q9D1D1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tspan11Q9D1D1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Tspan11Q9D1D1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Tspan11Q9D1D1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tspan11Q9D1D1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Tspan11Q9D1D1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Tspan11Q9D1D1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Tspan11Q9D1D1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Tspan11Q9D1D1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Tspan11Q9D1D1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Tspan11Q9D1D1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms