Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl52Q9D0Y8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mrpl52Q9D0Y8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl52Q9D0Y8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl52Q9D0Y8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl52Q9D0Y8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms